結構沢山ありますね。実際試したりとか全然してません。下のリストの中ではざっと見た感じ nanoc が有名っぽい。 sphinxもよく使われてますが、こっちは document generator みたいなタグ付けされて、Javadoc や Doxygen の仲間と分類されていることが多いよ…